Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
IFITM3Q01628 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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