Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TFAMQ00059 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms