Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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H3F3AP84243 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H3F3AP84243 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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