Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPS3AP61247 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms