Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBASH3AP57075 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms