Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN12P56749 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN12P56749 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN12P56749 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CLDN12P56749 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN12P56749 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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CLDN12P56749 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN12P56749 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN12P56749 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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CLDN12P56749 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN12P56749 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN12P56749 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN12P56749 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN12P56749 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN12P56749 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN12P56749 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN12P56749 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN12P56749 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN12P56749 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN12P56749 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN12P56749 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN12P56749 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN12P56749 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN12P56749 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN12P56749 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
CLDN12P56749 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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