Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 ERVK13-1-205ENST00000568395 5578 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 ZBTB49-201ENST00000337872 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 FARP1-201ENST00000319562 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 HEXA-201ENST00000268097 5252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 SETD3-204ENST00000436070 2592 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 PLB1-201ENST00000327757 5107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
ATP5EP56381 CELF1-204ENST00000395290 7666 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms