Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
RAD23AP54725 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms