Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ETV1P50549 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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ETV1P50549 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ETV1P50549 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ETV1P50549 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ETV1P50549 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ETV1P50549 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ETV1P50549 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ETV1P50549 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ETV1P50549 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ETV1P50549 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
ETV1P50549 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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