Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AC008750.5-201ENST00000595500 473 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSEN1P49768 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 AC099542.2-201ENST00000474149 553 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms