Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASP4P49662 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CASP4P49662 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CASP4P49662 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms