Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GPR4P46093 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GPR4P46093 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GPR4P46093 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPR4P46093 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPR4P46093 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPR4P46093 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GPR4P46093 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms