Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ATP5C1P36542 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATP5C1P36542 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms