Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA7P31268 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA7P31268 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms