Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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TSPOP30536 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPOP30536 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPOP30536 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPOP30536 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPOP30536 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPOP30536 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPOP30536 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPOP30536 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPOP30536 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPOP30536 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPOP30536 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TSPOP30536 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TSPOP30536 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TSPOP30536 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TSPOP30536 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TSPOP30536 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TSPOP30536 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TSPOP30536 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TSPOP30536 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TSPOP30536 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TSPOP30536 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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TSPOP30536 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TSPOP30536 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TSPOP30536 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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