Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMLP26374 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHMLP26374 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHMLP26374 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHMLP26374 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHMLP26374 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms