Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
POLR2AP24928 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
POLR2AP24928 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms