Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME1P15531 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME1P15531 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME1P15531 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME1P15531 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NME1P15531 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NME1P15531 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NME1P15531 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NME1P15531 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms