Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HPGDP15428 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HPGDP15428 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms