Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNNT1P13805 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms