Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACTN1P12814 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms