Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TOP2AP11388 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2AP11388 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms