Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LAMC1P11047 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms