Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
U2AF1L5P0DN76 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms