Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PRKNO60260 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PRKNO60260 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms