Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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