Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
COCHO43405 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
COCHO43405 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COCHO43405 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms