Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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HOXA3O43365 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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HOXA3O43365 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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HOXA3O43365 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
HOXA3O43365 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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