Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
E2F3O00716 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
E2F3O00716 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms