Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
UBXN8O00124 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms