Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf172C9J069 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf172C9J069 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms