Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ERVV-2B6SEH9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ERVV-2B6SEH9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms