Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SOBPA7XYQ1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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