Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PAXBP1Q9Y5B6 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PAXBP1Q9Y5B6 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms