Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
KLF12Q9Y4X4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
KLF12Q9Y4X4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms