Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TRAF6Q9Y4K3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TRAF6Q9Y4K3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms