Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Q9Y3F1 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms