Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SBNO2Q9Y2G9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SBNO2Q9Y2G9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms