Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SETD1BQ9UPS6 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms