Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PHF8Q9UPP1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PHF8Q9UPP1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms