Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
COPS3Q9UNS2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms