Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLEC4AQ9UMR7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms