Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CTNNA3Q9UI47 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CTNNA3Q9UI47 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms