Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CFDP1Q9UEE9 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CFDP1Q9UEE9 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms