Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CTNNAL1Q9UBT7 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms