Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRBP1Q9P2E9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms