Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCHIP1Q9P0W5 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms