Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NKIRAS2Q9NYR9 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms