Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RHBDL2Q9NX52 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RHBDL2Q9NX52 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms