Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PCDHB16Q9NRJ7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PCDHB16Q9NRJ7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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